谈到抽动症的原因，是非常复杂的，因此要达到对抽动症的根治必须从多个环节各个击破才可能成功。一言以蔽之，抽动症是遗传因素、神经生物因素、心理和社会环境因素等在儿童生长发育过程中相互综合作用的结果。尤其是社会心理和环境的紧张因素，譬如不良生活事件，如果在治疗过程中不被挖掘出来，当这些因素一直存在，儿童的抽动症往往是好转后又复发，将难以得到根治。一旦抽动症病程超过一年，演变成慢性抽动，治疗就更加的棘手。

抽动症具有明显的遗传倾向，单卵双生子的抽动症同病率高达100%，异卵双生子的同病率为23%，近年来国际上大量研究已发现多个基因与抽动症相关。

近年研究还发现抽动症与大脑中多种神经递质平衡失调有关，这些神经递质包括多巴胺、去甲肾上腺素、5-羟色胺、组胺、谷氨酸和γ-氨基丁酸等。大约20-35%的抽动症与感染后引发的自身免疫存在一定的关系，免疫反应损伤了神经精神系统。

性格内向、敏感脆弱、脑发育不成熟的儿童容易患上抽动症，学习和生活的压力、紧张、疲劳、焦虑、应激事件、精神创伤、观看恐怖片、动画片、父母管教过严、惩罚过多、对孩子忽视或虐待均可导致抽动症的发生。